目前公營交通船航行於大福漁港碼頭與東港碼頭之間，每日往返十個航次，不僅提供乘客便捷舒適的海上交通，還有團體的旅遊套裝行程可供選擇。
※ 25人以上，每人只要420元，即可享有三重優惠：
<1>來回船票（原價每人350元）
<2>風景區門票（原價每人120元）
<3>環島交通車（原價每人100元
對外交通
小琉球雖有一座機場，但並不啟用，前往小琉球完全仰賴船運。
船運
東港←→大福港有欣泰號（公船)
東港←→白沙港（白沙尾）有東信、觀光、良臺、眾益、飛馬五艘快艇（聯營船--民營)
中蕓漁港←→白沙港有佔岸輪。
東港至小琉球航程約25分鐘，中蕓漁港至小琉球約40分鐘。
大福漁港位處於琉球鄉的東南方，行政區域屬於大福村，為琉球鄉主要港口之一，提供公營交通船及一般漁業作業船隻停泊之用。由於大福漁港主要為遠洋漁船之停泊地點，所以該地區特別具有漁業產業文化之風貌。
小琉球垃圾復育場
階梯可下至海岸觀看礁石
大寮港
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清晨06:00出發---六合 興隆居 早餐--沿海公路(省17號)--07:10到達東港→ 東琉線交通船民營處 --搭08:00快艇--08:25到達 小琉球 → 小琉球交通船民營處-白沙港 →東岸-( 中澳沙灘 → 龍蝦洞 → 大福港-琉球公營交通 → 漁福村 → 厚石裙礁 ) → 海子口 → 觀落日亭 → 三隆宮 → 碧雲寺 → 靈山寺 (中餐)→西岸( → 蛤板灣 → 杉福漁港 → 杉福生態步道 → 杉福港潮間帶 → 沙瑪基島渡假區 → 小琉球潮間帶→ 小琉球潮間帶「幻燈片」) → 花瓶岩 --17:00鳳山(晚餐--羊火鍋)--返家
