縣名「連江」，與大陸福建省連江縣同名，下轄4鄉（南竿、北竿、莒光、東引）、22村、137鄰。縣政府位在南竿鄉介壽村。
地質條件上為花崗岩錐狀島嶼，地勢起伏大且陡峭。北竿島的壁山標高294公尺，為馬祖列島第一高峰。南竿第一高峰是雲台山，標是248公尺，已列為台灣地區小百岳之一。
地形多谷地、灣澳，海岸地區花崗質岩石，受風化及波浪侵蝕作用，多崩崖、險礁、海蝕洞、海蝕門等地形，部分灣澳地區經過沖積與堆積作用形成沙灘、礫石灘、卵石灘。全縣4鄉只有東引沒有沙灘。
馬祖列島，位於台灣海峽西北西方，四面環海，東距基隆114浬，西與福建閩江口，僅一水之隔 ，最近處僅約20公里。馬祖是由許多島嶼所組成，包括南竿、北竿、東莒、西莒、東引、亮島、高登、大坵、小坵還有許多無人島嶼，形成東西窄、南北狹長之地形，陸域面積2,952公頃，海域面積22,100公頃。其中以南竿為第一大島，為馬祖的政經文教中心, 人口密度較高者為南竿島約超過4千人。
當地居民多利用花崗岩塊，沿著山坡地興建，其結構多為方正雙層獨棟建築，窗戶小開於高處，窗櫺以石條為骨架，屋脊為曲線造型如火焰燃燒般的「封火山牆」，屋頂以紅或灰瓦覆蓋並於接縫處壓上石頭，以防強烈海風吹刮侵襲。
南竿http://www.matsu-nsa.gov.tw/show.aspx?&nowv=19&id=55
縣政府位在南竿鄉介壽村，南竿機場興建完成後，已成為馬祖海空交通、政治經濟、教育文化之中心，因此本地人皆稱南竿為「本島」。
福澳村的福澳國家商港是台馬輪與離島快輪的靠泊碼頭，是馬祖的海運中心。
南竿最高的雲台山，標高248公尺，為馬祖列島最二高，但卻由於已經入「台灣小百岳」，目前已成為南竿的觀光景點之一，在此可以眺望北竿列島、莒光列島與大陸河山，常令遊客留連忘返。
除了雲台山以外，南竿最具知名度的景點是位在仁愛村的北海坑道，此一興建於冷戰時期的地下坑道碼頭，工程浩大，鬼斧神工，令人嘆為觀止。此外，牛角聚落、津沙聚落、鐵堡、勝天公園、馬港天后宮、枕戈待旦、夫人村、馬祖民俗文物館，也都是南竿著名的觀光景點。
大陸政權易手後，馬祖進入近40餘年之戰地政務與軍管時期，所有皆劃為軍事重地。隨處可見軍事建築、鬼斧神工的地下坑道及港口、據點、砲座、訓練場所、軍醫院等設施，深具獨特戰地風光。自1992年11月7日起正式解除戰地政務後，軍方已陸續開放不同類型之軍事觀光資源，交由連江縣政府與國家風景區管理處經營供遊客參訪。
馬祖列島簡介http://tour.matsu.idv.tw/
導覽地圖
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熱門景點‧
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風速在10月至翌年3月間，大陸冷氣團南下，有強烈東北季風吹襲，故風速最大；尤其是3至5月間，開始吹南風形成多雲霧的天氣。每年春天，南風從台灣海峽帶來暖濕空氣，和氣溫較低的地面、水域接觸，便形成濃霧。平流霧的厚度可達七、八百公尺以上，天氣好時的日間太陽幅射最多只能消除雲層頂部一部分，因此；如果平流霧歷久不散，能見度驟降，這就是為何飛機航班常常於此季節飛飛停停的原因。
馬祖地區全年降雨量多集中於4至5月，颱風則多發生於7、8月，年平均雨量約1060公釐，不到台灣雨量的一半，雨季集中在4至9月的梅雨季及颱風季。
